《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
尚论后篇
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
裘序叶序原序卷上辨春夏秋冬温暑凉寒四证病原天时地气辨寒暑证各异暑证暑厥暑风暑疡暑瘵绞肠痧时疫（见朱丹溪）寒疫脉理五运六气五运配十干之年六气为司天之岁南政北政十二支年分运气增订客气客运活法卷中古今名医暑
自序序发凡卷一保胎论广嗣论男女辨随孕随产论坠胎论小产失调枉死论胎教胎前饮食成胎造化章孕脉论孕后便览卷二保产辑要总论难产七因酷暑严冬节录临产达生要言临产调护法产后救护法三字宝临盆七候产后便览产后忌食诸物
素灵微蕴序素灵微蕴卷一胎化解脏象解经脉解营卫解脏候解素灵微蕴卷二五色解五声解问法解诊法解医方解素灵微蕴卷三齁喘解吐血解惊悸解悲恐解飧泄解肠澼解脾胃解火逆解素灵微蕴卷四消渴解气鼓解噎膈解反胃解中风解带下
自序卷一医范医鉴慎疾保生慎药求医诊法脉用药卷二古人今人古书今书卷三形体中风伤寒阴证阳证暑暑风霍乱转筋（俗称吊脚痧）热热入心胞疫痧疟三阴疟痢泻疝咳嗽噎吐头痛胁痛腹痛肝病七情不寐卷四吐血诸血汗疸肿消伤食邪
序一序二序三卷上十二经总括诊三部脉法三部九候左右三部六候四季脉名诊五脏四季常脉定四季六脏平脉定四季相克脉诊五脏贼邪脉诊四时虚实脉歌下指轻重法诊五脏动脉法诊六腑平脉法脉息大数诊五脏脉诀男女反脉观人形性脉
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论