卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
一瓢医案
序祭神应王文岐伯阴阳脉例洁古老人内伤三阴例海藏老人内伤三阴例伤在少阴伤在太阳阴阳寒热各从类生服药同象伊芳尹汤液论例扁鹊仲景例仲景阴证论例易老法霍乱吐泻足阳明总摄六经霍乱与少阴寒热同候叔和阴脉例活人阴脉
玉石部上品丹砂玉泉玉屑云母石钟乳朴硝芒硝硝石玄明粉生硝矾石滑石空青曾青石胆绿青赤石脂白石脂青石脂黑石脂黄石脂白石英紫石英禹余粮太一余粮无名异绿矾柳絮矾婆娑石中品雄黄石硫黄雌黄食盐水银石膏金屑银屑生银灵
金匮玉函要略方论序金匮要略序（出赵本．）金匮玉函要略综概卷一脏腑经络先后病脉证第一（论十三首、脉证三条）湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
宣明方论
序总述修养宜行外功第一合行外功诀十二段锦歌八段杂锦歌擦面美颜诀六字治脏诀六字行功根据式样歌六字行功应时候歌六字行功各效验歌修养宜内联功第二修养宜宝精宝气宝神第三总论精气神精气神全神语一字安心之要修养宜
序产后总论胞衣不下块痛血崩血晕手足厥冷类伤寒类中风类疟妄言妄见气短发喘咳嗽自汗盗汗大便不通小便不通呕吐不纳谷伤食膨胀泄泻痢疾烦闷产后调护法
自序经脉肺手太阴之脉手太阴肺经图肺经诸穴歌又分寸歌大肠手阳明之脉手阳明大肠经图大肠经诸穴歌又分寸歌胃足阳明之脉足阳明胃经图胃经诸穴歌又分寸歌脾足太阴之脉足太阴脾经图脾经诸穴歌又分寸歌心手少阴之脉手少阴